danДоклады Национальной академии наук БеларусиDoklady of the National Academy of Sciences of Belarus1561-83232524-2431The Republican Unitary Enterprise Publishing House "Belaruskaya Navuka"dan-103Research ArticleХИМИЯCHEMISTRYКОМПЬЮТЕРНЫЙ СКРИНИНГ НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНЫХ ИНГИБИТОРОВ ПРОНИКНОВЕНИЯ ВИЧ-1 НА ОСНОВЕ НЕЙТРАЛИЗУЮЩЕГО АНТИТЕЛА 10Е8COMPUTER-AIDED SCREENING OF SMALL-MOLECULE HIV-1 ENTRY INHIBITORS BASED ON NEUTRALIZING ANTIBODY 10E8КАШИНИ. А.KASHYNI. A.ТУЗИКОВА. В.TUZIKOVA. V.

член-корреспондент

АНДРИАНОВА. М.ANDRIANOVA. M.andrianov@iboch.bas-net.byИнститут биоорганической химии НАН Беларуси, МинскBelarusОбъединенный институт проблем информатики НАН Беларуси, МинскBelarus2015010620165935665Copyright © КАШИН И.А., ТУЗИКОВ А.В., АНДРИАНОВ А.М., 20162016КАШИН И.А., ТУЗИКОВ А.В., АНДРИАНОВ А.М.KASHYN I.A., TUZIKOV A.V., ANDRIANOV A.M.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://doklady.belnauka.by/jour/article/view/103

Проведен компьютерный скрининг низкомолекулярных ингибиторов проникновения ВИЧ-1 - потенциальных пептидомиметиков моноклонального антитела 10Е8, проявляющего широкую вирусную нейтрализацию. Методами молекулярного моделирования идентифицированы восемь химических соединений, способных к блокаде сегмента белка gp41 ВИЧ-1, критического для слияния мембраны вируса с клеткой-мишенью. Найденные соединения рассматриваются как перспективные базовые структуры для разработки новых лекарственных препаратов против ВИЧ с широким спектром нейтрализующего действия.

Computer-based screening of small-molecule HIV-1 entry inhibitors presenting potential peptidomimetics of broadly neutralizing monoclonal antibody 10E8 is carried out. Eight chemical compounds able to block the HIV-1 gp41 segment critical for fusion of the virus membrane with a target cell were identified using molecular modeling. These compoundsare considered as promising basic structures for the design of novel broad anti-HIV drugs

ReferencesArts E. J., Hazuda D. J. // Cold Spring Harb. Perspect. Med. 2012. Vol. 2. P. a007161.Arts E. J., Hazuda D. J. // Cold Spring Harb. Perspect. Med. 2012. Vol. 2. P. a007161.Tilton J. C., Doms R. W. // Antiviral Res. 2010. Vol. 85. P. 91–100.Tilton J. C., Doms R. W. // Antiviral Res. 2010. Vol. 85. P. 91–100.Vermeire K., Schols D., Bell T. W. // Curr. Med. Chem. 2006. Vol. 13. P. 731–743.Vermeire K., Schols D., Bell T. W. // Curr. Med. Chem. 2006. Vol. 13. P. 731–743.Sirois S., Sing T., Chou K. C. // Curr. Protein Pept. Sci. 2005. Vol. 6. P. 413–422.Sirois S., Sing T., Chou K. C. // Curr. Protein Pept. Sci. 2005. Vol. 6. P. 413–422.Andrianov A. M. // Expert Opin. Drug Discov. 2011. Vol. 6. P. 419–435.Andrianov A. M. // Expert Opin. Drug Discov. 2011. Vol. 6. P. 419–435.McCoy L. E., Weiss R. A. // J. Exp. Med. 2013. Vol. 210. P. 209–223.McCoy L. E., Weiss R. A. // J. Exp. Med. 2013. Vol. 210. P. 209–223.Huang J., Ofek G., Laub L. et al. // Nature. 2012. Vol. 491. P. 406–414.Huang J., Ofek G., Laub L. et al. // Nature. 2012. Vol. 491. P. 406–414.Кашин И. А., Тузиков А. В., Андрианов А. М. // Докл. НАН Беларуси. 2015. Т. 59, № 1. С. 68–73.Кашин И. А., Тузиков А. В., Андрианов А. М. // Докл. НАН Беларуси. 2015. Т. 59, № 1. С. 68–73.Floris M., Masciocchi J., Fanton M., Moro S. // Nucl. Acids Res. 2011. Vol. 39 (suppl. 2). P. W261–W269.Floris M., Masciocchi J., Fanton M., Moro S. // Nucl. Acids Res. 2011. Vol. 39 (suppl. 2). P. W261–W269.Masciocchi J., Frau G., Fanton M. et al. // Nucl. Acids Res. 2009. Vol. 37. P. D284–D290.Masciocchi J., Frau G., Fanton M. et al. // Nucl. Acids Res. 2009. Vol. 37. P. D284–D290.Lipinski C. A., Lombardo F., Dominy B. W., Feeney P. J. // Adv. Drug Delivery Rev. 2001. Vol. 46. P. 3–26.Lipinski C. A., Lombardo F., Dominy B. W., Feeney P. J. // Adv. Drug Delivery Rev. 2001. Vol. 46. P. 3–26.Trott O., Olson A. J. // J. Comput. Chem. 2010. Vol. 31. P. 455–461.Trott O., Olson A. J. // J. Comput. Chem. 2010. Vol. 31. P. 455–461.Durrant J. D., McCammon J. A. // J. Chem. Inf. Model. 2010. Vol. 50. P. 1865–1871.Durrant J. D., McCammon J. A. // J. Chem. Inf. Model. 2010. Vol. 50. P. 1865–1871.Case D. A., Darden T. A., Cheatham T. E. et al. // AMBER 11, University of California, San Francisco, 2010.Case D. A., Darden T. A., Cheatham T. E. et al. // AMBER 11, University of California, San Francisco, 2010.Munoz-Barroso I., Salzwedel K., Hunter E., Blumenthal R. // J. Virol. 1999. Vol. 73. P. 6089–6092.Munoz-Barroso I., Salzwedel K., Hunter E., Blumenthal R. // J. Virol. 1999. Vol. 73. P. 6089–6092.Salzwedel K., West J. T., Hunter E. // J. Virol. 1999. Vol. 73. P. 2469–2480.Salzwedel K., West J. T., Hunter E. // J. Virol. 1999. Vol. 73. P. 2469–2480.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.