danДоклады Национальной академии наук БеларусиDoklady of the National Academy of Sciences of Belarus1561-83232524-2431The Republican Unitary Enterprise Publishing House "Belaruskaya Navuka"10.29235/1561-8323-2019-63-3-312-316dan-617Research ArticleБИОЛОГИЯBIOLOGYАнализ структурно-функциональной организации хлоропластного генома карельской березы на основании данных высокопроизводительного секвенированияAnalysis of structural and functional organization of the curly birch chloroplast genome based on the next-generation sequencing dataБарановО. Ю.BaranovO. Yu.

Баранов Олег Юрьевич – д-р биол. наук, доцент, заведующий сектором

ул. Пролетарская, 71, 246050, Гомель, Республика Беларусь

Baranov Oleg Yur’evich – D. Sc. (Biology), Assistant professor, Head of the Department

71, Proletarskaya Str., 246050, Gomel, Republic of Belarus

betula-belarus@mail.ruКирьяновП. С.KiryanovP. S.

Кирьянов Павел Сергеевич – мл. науч. сотрудник

ул. Пролетарская, 71, 246050, Гомель, Республика Беларусь

Kiryanov Pavel Sergeevich – Junior researcher

71, Proletarskaya Str., 246050, Gomel, Republic of Belarus

Pkirjanov@yandex.ruПантелеевС. В.PantelevS. V.

Пантелеев Станислав Викторович – канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник

ул. Пролетарская, 71, 246050, Гомель, Республика Беларусь

Panteleev Stanislav Victorovich – Ph. D. (Biology), Senior researcher

71, Proletarskaya Str., 246050, Gomel, Republic of Belarus

stasikdesu@mail.ruМожаровскаяЛ. В.MozharovskayaL. V.

Можаровская Людмила Валентиновна – мл. науч. сотрудник

ул. Пролетарская, 71, 246050, Гомель, Республика Беларусь

Mozharovskaya Ludmila Valentinovna – Junior researcher

71, Proletarskaya Str., 246050, Gomel, Republic of Belarus

milamozh@yandex.ruПадутовА. В.PadutovA. V.

Падутов Александр Владимирович – мл. науч. сотрудник

ул. Пролетарская, 71, 246050, Гомель, Республика Беларусь

Padutov Alexandr Vladimirovich – Junior researcher

71, Proletarskaya Str., 246050, Gomel, Republic of Belarus

apadutov@yandex.byРазумоваО. А.RazumovaO. A.

Разумова Ольга Александровна – канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник

ул. Пролетарская, 71, 246050, Гомель, Республика Беларусь

Razumova Olga Alexandrovna – Ph. D. (Biology), Senior researcher

71, Proletarskaya Str., 246050, Gomel, Republic of Belarus

o-kovalevich@mail.ruПадутовВ. Е.PadutovV. E.

Падутов Владимир Евгеньевич – член-корреспондент, д-р биол. наук, заведующий лабораторией

ул. Пролетарская, 71, 246050, Гомель, Республика Беларусь

Padutov Vladimir Evgen’evich – Corresponding Member, D. Sc. (Biology), Head of the Laboratory

71, Proletarskaya Str., 246050, Gomel, Republic of Belarus

forestgen@mail.ruИнститут леса Национальной академии наук БеларусиForest Research Institute of the National Academy of Sciences of Belarus201927062019633312316Copyright © Баранов О.Ю., Кирьянов П.С., Пантелеев С.В., Можаровская Л.В., Падутов А.В., Разумова О.А., Падутов В.Е., 20192019Баранов О.Ю., Кирьянов П.С., Пантелеев С.В., Можаровская Л.В., Падутов А.В., Разумова О.А., Падутов В.Е.Baranov O.Y., Kiryanov P.S., Pantelev S.V., Mozharovskaya L.V., Padutov A.V., Razumova O.A., Padutov V.E.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://doklady.belnauka.by/jour/article/view/617

Проведено секвенирование и аннотация хлоропластного генома карельской березы. Выявлен высокий уровень сходства структурно-функциональной организации хпДНК среди видов семейства Betulaceae. Разработан набор праймеров для оценки уровня экспрессии EST-маркеров хпДНК карельской березы методом ПЦР-РВ.

The sequencing and annotation of the curly birch chloroplast genome were carried out. A high level of similarity of the structural and functional organization of cpDNA among the species of the Betulaceae family was revealed. A set of primers was developed to assess the level of expression of EST markers of the curly birch cpDNA by the real time PCR method.

хпДНКвысокопроизводительное секвенированиекарельская березаcpDNAnext-generation sequencingcurly birchРабота выполнена при поддержке Белорусского республиканского фонда фундаментальных исследований (проект № Б17-63).The work was sponsored by the Belarusian Republication Foundation for Fundamental Research (Project No. Б17-63).ReferencesВетчинникова, Л. В. Происхождение карельской березы: эколого-генетическая гипотеза / Л. В. Ветчинникова, А. Ф. Титов // Экологическая генетика. – 2016. – Т. 14, № 2. – С. 3–18. https://doi.org/10.17816/ecogen1423-18Vetchinnikova L. V., Titov A. F. Genesis of the karelian Birch. An Ecogenetic hypothesis. Ecoligical genetics, 2016, vol. 14, no. 2, pp. 3–18 (in Russian). https://doi.org/10.17816/ecogen1423-18Bajaj, Y. S. Plant Protoplasts and Genetic Engineering II / Y. S. Bajaj. – Berlin, 1989. – 499 p. https://doi.org/10.1007/978-3-642-74454-9Bajaj Y. S. Plant Protoplasts and Genetic Engineering II. Berlin, 1989. 499 p. https://doi.org/10.1007/978-3-642-74454-9Methods for obtaining and analyzing whole chloroplast genome sequences / R. K. Jansen [et al.] // Methods in enzymology. – 2005. – Vol. 395. – P. 348–384. https://doi.org/10.1016/s0076-6879(05)95020-9Jansen R. K., Raubeson L. A., Boore J. L., De Pamphilis C. W., Chumley T. W., Haberle R. C., Wyman S. K., Alverson A. J., Sallie R. P., Herman J., Matthew H., Jennifer F., Kuehl V., McNeal J. R., Leebens-Mack J., Cui L. Methods for obtaining and analyzing whole chloroplast genome sequences. Methods in enzymology, 2005, vol. 395, pp. 348–384. https://doi.org/10.1016/s0076-6879(05)95020-9National center for biotechnology information [Electronic resource]. – Mode of access: https://www.ncbi.nlm.nih.gov. – Date of access: 17.07.2018.National center for biotechnology information. Available at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov (аccessed 17 July 2018).Перечень праймеров для амплификации методом ПЦР локусов хпДНК [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://mega.nz/#!WoUXSA7l!BQ3BtGtZAI7jnQsEX0Vh7VaXNHjU4lJPJD9oWRMU2-4. – Дата доступа: 13.08.2018.The list of PCR primers for amplification of the loci of cpDNA. Available at: https://mega.nz/#!WoUXSA7l!BQ3BtGtZAI7jnQsEX0Vh7VaXNHjU4lJPJD9oWRMU2-4 (аccessed 13 August 2018).

The authors declare that there are no conflicts of interest present.