Структурное обоснование активации киназы ZAP-70 при фосфорилировании тирозинов 315, 319 и 493
https://doi.org/10.29235/1561-8323-2023-67-1-38-40
Аннотация
Тирозиновая киназа ZAP-70 (Zeta-chain-Associated Protein kinase 70) является ключевым ферментом в регуляции адаптивного иммунного ответа. Cвязываясь своими SH2-доменами с цитоплазматическим доменом белка CD3ζ, ассоциированного с T-клеточным рецептором, Zap-70 осуществляет передачу активационного сигнала к T-лимфоцитам, индуцированного взаимодействием главного комплекса гистосовместимости с T-клеточным рецептором. Известно, что для киназной активации ZAP-70 также необходимым является фосфорилирование тирозинов 315, 319 и 493, однако механизмы активации неясны. В настоящем исследовании использованы средства молекулярной структурной биологии для установления этих механизмов.
Об авторах
В. А. УрбанБеларусь
Урбан Виктор Андреевич – мл. науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, Минск
В. Г. Вересов
Россия
Вересов Валерий Гавриилович – д-р биол. наук, гл. науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, Минск
Список литературы
1. Mariuzza, R. A. The structural basis of T-cell receptor (TCR) activation: An enduring enigma / R. A. Mariuzza, P. Agnihotri, J. Orban // J. Biol. Chem. – 2020. – Vol. 295, N 4. – P. 914–925. https://doi.org/10.1074/jbc.rev119.009411
2. Structural basis for the inhibition of tyrosine kinase activity of ZAP-70 / S. Deindl [et al.] // Cell. – 2007. – Vol. 129, N 4. – P. 735–746. https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.03.039
3. Structural basis for activation of ZAP-70 by phosphorylation of the SH2-kinase linker / Q. Yan [et al.] // Mol. Cell Biol. – 2013. – Vol. 33, N 11. – P. 2188–2201. https://doi.org/10.1128/mcb.01637-12
4. Roy, A. I-TASSER: a unified platform for automated protein structure and function prediction / A. Roy, A. Kucukural, Y. Zhang // Nat. Protoc. – 2010. – Vol. 5, N 4. – P. 725–738. https://doi.org/10.1038/nprot.2010.5
5. Heo, L. GalaxyRefine: Protein structure refinement driven by side-chain repacking / L. Heo, H. Park, C. Seok // Nucleic Acids Res. – 2013. – Vol. 41, N W1. – P. W384–W388. https://doi.org/10.1093/nar/gkt458
6. Margreitter, C. Vienna-PTM web server: a toolkit for MD simulations of protein post-translational modifications / C. Margreitter, D. Petrov, B. Zagrovic // Nucleic Acids Res. – 2013. – Vol. 41, N W1. – P. W422–W426. https://doi.org/10.1093/nar/gkt416
7. GROMACS 4.5: a high-throughput and highly parallel open source molecular simulation toolkit / S. Pronk [et al.] // Bioinformatics. – 2013. – Vol. 29, N 7. – P. 845–854. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btt055
8. A Systematic Framework for Molecular Dynamics Simulations of Protein Post-Translational Modifications / D. Petrov [et al.] // PLOS Computational Biology. – 2013. – Vol. 9, N 7. – Art. e1003154. https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1003154