Preview

Доклады Национальной академии наук Беларуси

Доклады Национальной академии наук Беларуси

Расширенный поиск

Сравнительный анализ эффективности ДНК-маркеров для видовой идентификации растений рода Береза (Betula)

https://doi.org/10.29235/1561-8323-2026-70-5-383-389

Аннотация

Проведена сравнительная оценка разрешающей способности хлоропластных (rbcL, psbA-trnH, matK) и ядерных (ITS1, ITS2) молекулярных маркеров для видовой идентификации представителей рода Betula. Показано, что хлоропластные последовательности характеризуются низкой вариабельностью, причем наихудший результат получен для rbcL. Напротив, маркеры ITS-региона обладают значительно более высокой дифференцирующей способностью. ITS2 продемонстрировал потенциал для определения десяти видов (от 61,7 до 93,1 %), тогда как наилучшие показатели были выявлены для ITS1: наибольшее количество достоверно определяемых видов (5 видов с эффективностью 100 % и 11 – выше 65 %), индекс баркодирования для него достиг максимального среди всех исследованных маркеров значения (6,04), а доля пар с перекрытием внутривидовой и межвидовой изменчивости оказалась наименьшей (26,66 %). Совокупность полученных данных позволяет рассматривать ITS1 в качестве наиболее надежного молекулярного маркера для идентификации видов рода Betula.

Об авторах

А. Н. Верчук
Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь

Верчук Алексей Николаевич – науч. сотрудник 

ул. Академическая, 27, 220072, Минск 



А. В. Кильчевский
Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь

Кильчевский Александр Владимирович – академик, д-р биол. наук, профессор, руководитель лаборатории

ул. Академическая, 27, 220072, Минск 



Список литературы

1. World Flora Online (2024): Betula L. – URL: https://www.worldfloraonline.org/taxon/wfo-4000004547 (date of access: 11.02.2026).

2. Восстановление лесов идет по всей Беларуси. Присоединиться может каждый! // Министерство лесного хозяйства Республики Беларусь. – URL: https://mlh.gov.by/news/13977/ (дата обращения: 11.02.2026).

3. Информационно-поисковая система Центрального ботанического сада НАН Беларуси. – URL: https:// web.archive.org/web/20241113022706/http://hbc.bas-net.by/plantae/default.php?otdel=eNortjI0slI68vTD00f_3774-On3UyVrXDB2NQzB&type=ras (дата обращения: 23.06.2026).

4. Tarieiev, A. S. ITS secondary structure reconstruction to resolve taxonomy and phylogeny of the Betula L. genus / A. S. Tarieiev, O. Gailing, K. V. Krutovsky // PeerJ. – 2021. – Vol. 9. – Art. e10889. https://doi.org/10.7717/peerj.10889

5. Pollen DNA barcoding: current applications and future prospects / K. L. Bell, N. de Vere, A. Keller [et al.] // Genome. – 2016. – Vol. 59, N 9. – P. 629–640. https://doi.org/10.1139/gen-2015-0200

6. Верчук, А. Н. Направления современной палинологии и перспективы использования баркодирования ДНК для дифференциации растений по пыльце / А. Н. Верчук, С. В. Кубрак, А. В. Кильчевский // Молекулярная и прикладная генетика. – 2021. – Т. 31. – С. 134–146.

7. Biological identifications through DNA barcodes / P. D. N. Hebert, A. Cywinska, S. L. Ball, K. R. deWaard // Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences. – 2003. – Vol. 270, N 1512. – P. 313–321. https://doi.org/10.1098/rspb.2002.2218

8. A DNA Barcode for land plants / CBOL Plant Working Group, P. M. Hollingsworth, L. L. Forrest [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. – 2009. – Vol. 106, N 31. – P. 12794–12797. https://doi.org/10.1073/pnas.0905845106

9. Верчук, А. Н. Тестирование коммерческих наборов и методов выделения ДНК для молекулярно-генетических исследований пыльцы растений / А. Н. Верчук, А. В. Кильчевский // Молекулярная и прикладная генетика. – 2024. – Т. 36. – С. 71–81.

10. Chinchor, N. MUC-4 evaluation metrics / N. Chinchor // Proceedings of the Fourth Conference on Message Understanding. – McLean, Virginia, 1992. – P. 22–29. https://doi.org/10.3115/1072064.1072067


Рецензия

Просмотров: 19

JATS XML


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1561-8323 (Print)
ISSN 2524-2431 (Online)