Метагеномный анализ микробного сообщества засоленных почв
https://doi.org/10.29235/1561-8323-2026-70-5-390-398
Аннотация
На основе метагеномного анализа изучена структура прокариотных сообществ почв, подверженных длительному техногенному засолению в зоне влияния выбросов ОАО «Беларуськалий». Показано, что основу почвенного микробиома формируют бактерии (филумы домена Bacteria), тогда как представители домена Archaea (филумы Thermoproteota и Methanobacteriota) составляют его меньшую часть. Установлено, что в локациях складирования глинисто-солевого шлама доминируют бактерии классов Actinomycetes, Bacteroidia, Alphaproteobacteria и Gammaproteobacteria. Непосредственно у основания терриконов и в ближней зоне их влияния обнаружены фотосинтезирующие прокариоты класса Cyanobacteriia, а во всех исследованных образцах зафиксировано равномерное присутствие бактерий класса Bacilli. Полученные результаты расширяют представления о функциональном разнообразии микробных сообществ почв в условиях антропогенного стресса и могут служить основой для разработки биотехнологий рекультивации засоленных земель.
Ключевые слова
Об авторах
Н. И. НаумовичБеларусь
Наумович Надежда Ивановна – канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник
ул. Купревича, 2, 220084, Минск
З. М. Алещенкова
Беларусь
Алещенкова Зинаида Михайловна – д-р биол. наук, профессор, гл. науч. сотрудник
ул. Купревича, 2, 220084, Минск
Е. Е. Адронов
Россия
Андронов Евгений Евгеньевич – д-р биол. наук, гл. науч. сотрудник
шоссе Подбельского, 3, 196608, Пушкин-8, Санкт-Петербург
Список литературы
1. Enebe, M. C. The influence of plant growth-promoting rhizobacteria in plant tolerance to abiotic stress: a survival strategy / M. C. Enebe, O. O. Babalola // Applied Microbiology and Biotechnology. – 2018. – Vol. 102. – P. 7821–7835. https://doi.org/10.1007/s00253-018-9214-z
2. Microbial diversity and functions in saline soils: A review from a biogeochemical perspective / G. Zhang, J. Bai, Y. Zhai [et al.] // Journal of Advanced Research. – 2024. – Vol. 59. – P. 129–140. https://doi.org/10.1016/j.jare.2023.06.015
3. Чернов, Т. И. Метагеномный анализ прокариотных сообществ профилей почв европейской части России: дис. … канд. биол. наук: 03.02.03 / Чернов Тимофей Иванович. – М., 2015. – 111 с.
4. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil / S. T. Bates, D. Berg-Lyons, J. G. Caporaso [et al.] // The International Society for Microbial Ecology Journal. – 2011. – Vol. 5, N 5. – P. 908–917. https://doi.org/10.1038/ismej.2010.171
5. Callahan, B. J. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data / B. J. Callahan, P. J. McMurdie, M. J. Rosen // Nature Methods. – 2016. – Vol. 13. – P. 581–853. https://doi.org/10.1038/nmeth.3869
6. McMurdie, P. J. phyloseq: An R рackage for reproducible interactive analysis and graphics of microbiome census data / P. J. McMurdie, S. Holmes // PLOS one. – 2013. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0061217
7. Wright, E. S. Using DECIPHER v2.0 to analyze big biological sequence data in R / E. S. Wright // R Journal. – 2016. – Vol. 8, N 1. – P. 352–359. https://doi.org/10.32614/RJ-2016-025
8. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools / C. Quast, E. Pruesse, P. Yilmaz [et al.] // Nucleic Acids Research. – 2013. – Vol. 41, N D1. – P. D590–D596. https://doi.org/10.1093/nar/gks1219
9. QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data / J. G. Caporaso, J. Kuczynski, J. Stombaugh [et al.] // Nature Methods. – 2010. – Vol. 7. – P. 335–336. https://doi.org/10.1038/nmeth.f.303
10. Pan-genome analysis and ancestral state reconstruction of class halobacteria: probability of a new super-order / S. Gaba, A. Kumari, M. Medema, R. Kaushik // Scientific Reports. – 2020. – Vol. 10. – Art. 21205. https://doi.org/10.1038/s41598-020-77723-6
11. Marinobacter: A case study in bioelectrochemical chassis evaluation / L. J. Bird, R. L. Mickol, B. J. Eddie [et al.] // Microbial Biotechnology. – 2023. – Vol. 16, N 3. – P. 494–506. https://doi.org/10.1111/1751-7915.14170
12. The hypersaline soils of the odiel saltmarshes natural area as a source for uncovering a new taxon: Pseudidiomarina terrestris sp. nov / C. Galisteo, R. R. de la Haba, A. Ventosa, C. Sánchez-Porro // Microorganisms. – 2024. – Vol. 12, N 2. – Art. 375. https://doi.org/10.3390/microorganisms12020375
13. Han, D. Diverse biofilm-forming Sphingomonadaceae represent twelve novel species isolated from glaciers on the Tibetan Plateau / D. Han, Y. H. Xin, Q. Liu // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. – 2025. – Vol. 75, N 9. – Art. 006913. https://doi.org/10.1099/ijsem.0.006913
14. Actinomycetes in the spotlight: biodiversity and their role in bioremediation / H. S. Hashim, M. M. Zayan, A. A. Mohamed, H. I. A. El Rahman Abulila // World Journal of Microbiology and Biotechnology. – 2026. – Vol. 42. – Art. 44. https://doi.org/10.1007/s11274-025-04610-5
15. Actinomycetes as an environmental scrubber / S. Devanshi, K. R. Shah, S. Arora, S. Saxena // Crude Oil – New Technologies and Recent Approaches. – 2021. – URL: https://www.intechopen.com/chapters/78507 (date of access: 30.07.2026).
16. Выделение и идентификация микроорганизмов, устойчивых к засолению почв / Н. И. Наумович, З. М. Алещенкова, И. Н. Ананьева [и др.] // Весці Нацыянальнай aкадэміі навук Беларусі. Серыя біялагічных навук. – 2022. – Т. 67, № 1. – С. 54–65. https://doi.org/10.29235/1029-8940-2022-67-1-54-65
17. Allaf, M. M. Cyanobacteria: Model microorganisms and beyond / M. M. Allaf, H. Peerhossaini // Microorganisms. – 2022. – Vol. 10, N 4. – Art. 696. https://doi.org/10.3390/microorganisms10040696
18. Bacillales: from taxonomy to biotechnological and industrial perspectives / S. Harirchi, T. Sar, M. Ramezani [et al.] // Microorganisms. – 2022. – Vol. 10, N 12. – Art. 2355. https://doi.org/10.3390/microorganisms10122355
19. Молекулярно-генетическая характеристика галотолерантного штамма Priestia megaterium БИМ В-1314Д / Н. И. Наумович, З. М. Алещенкова, И. Н. Ананьева [и др.] // Доклады Национальной академии наук Беларуси. – 2022. – Т. 66, № 1. – С. 55–64. https://doi.org/10.29235/1561-8323-2022-66-1-55-64
Рецензия
JATS XML





































