Изучение видового состава микробиома фитофагов цветочных растений на основании данных ДНК-штрихкодирования

С использованием метода баркодирования ДНК проведена молекулярно-генетическая идентификация доминирующего видового состава микробиома фитофагов многолетних цветочных растений. Выявлены различные варианты видовых сочетаний в системе «микробиота–фитофаг», а также изучены способы переноса фитофагами патогенной микрофлоры.

ДНК, ДНК-штрихкодирование, ген, полимеразная цепная реакция, секвенирование, фитопатоген, фитофаг, микробиом, многолетние цветочные растения

1. Титок, В. В. Генофонд орнаментальных растений Центрального ботанического сада НАН Беларуси: современное состояние и перспективы устойчивого развития / В. В. Титок, И. К. Володько, Н. Л. Белоусова // Цветоводство: история, теория, практика: матер. VII междунар. науч. конф. – Минск, 2016. – С. 390–392.

2. Ten species in one: DNA barcoding reveals cryptic species in the neotropical skipper butterfly Astraptes fulgerator / P. Hebert [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. – 2004. – Vol. 101, N 41. – P. 14812–14817. https://doi.org/10.1073/pnas.0406166101

3. Taylor, H. R. An emergent science on the brink of irrelevance: a review of the past 8 years of DNA barcoding / H. R. Taylor, W. E. Harris // Molecular Ecology Resources. – 2012. – Vol. 12, N 3. – P. 377–388. https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2012.03119.x

4. Perilla-Henao, L. M. Vector-Borne Bacterial Plant Pathogens: Interactions with Hemipteran Insects and Plants / L. M. Perilla-Henao, C. L. Casteel // Front Plant Sci. – 2016. – Vol. 7. – P. 1–15. https://doi.org/10.3389/fpls.2016.01163

5. Пантелеев, С. В. Оценка роли насекомых в распространении возбудителей кладоспориоза и альтернариоза в лесных питомниках на основании использования методов ДНК-анализа / С. В. Пантелеев // Тр. БГТУ. Лесное хозяйство. – 2012. – № 1 (148). – С. 253–257.

6. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase I from diverse metazoan invertebrates / O. Folmer [et al.] // Mol. Marine Biol. Biotechnol. – 1994. – Vol. 3. – P. 294–299.

7. Evolution, weighting and phylogenetic utility of mitochondrial gene sequences and a compilation of conserved polymerase chain reaction primers / C. Simon [et al.] // Ann. Entomol. Soc. Amer. – 1994. – Vol. 87, N 6. – P. 651–701. https://doi.org/10.1093/aesa/87.6.651

8. Gardes, M. ITS primers with enhanced specifity for basidiomycetes application of the identification of mycorrhizae and rusts / M. Gardes, T. D. Bruns // Mol. Ecol. – 1993. – Vol. 2, N 2. – P. 113–118. https://doi.org/10.1111/j.1365-294x.1993.tb00005.x

9. Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics / T. White [et al.] // PCR protocols: a guide to methods and applications. – 1990. – P. 315–322.

10. Anthony, R. M. Rapid diagnosis of bacteremia by universal amplification of 23S ribosomal DNA followed by hybridization to an oligonucleotide array / R. M. Anthony, T. J. Brown, G. L. French // J. Clin. Microbiol. – 2000. – Vol. 38, N 2. – P. 781–788.

11. National Center for Biotechnological Information, NCBI [Electronic resource]. – Mode of access: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/. – Date of access: 24.05.2018.